Ozonlama sistemi ortamda genel ferahlık, sanitasyon, koku giderimi için en uygun yöntemdir. Ana dağıtım kanalları ile düzgün ve yaygın bir dağılma sağlanır. Klima santraline bir veya birkaç noktadan ozonlu hava verilir; kanal içinde ozon konsantrasyonu ölçülerek otomatik seviye kontrolü yapılır, böylece aşırı konsantrasyonlar önlenir. Kanallar sayesinde ozon havalandırma menfezinden çıkarak her tarafa dağılır, dolayısıyla yaygın bir dezenfeksiyon, koku giderme ile flokülasyon nano partiküllerin birleştirilmesi işlevini gerçekleştirir.

Havalandırma sistemleri içinde, ısı eşanjörlerinde kolonileşen legionella bakterisine karşı etkili olur. Bununla birlikte, legionella tehlikesine karşı, zaman zaman klima santralinin soğutucu bölümünde, yüksek ozon konsantrasyonlu şoklama yapılması tavsiye edilir, bunun için santralin çalışmadığı bir zaman tercih edilmelidir.